Libretto100でX Windowを800x480で動かすには
XサーバーがLCDサイズを800x600と思ってしまいます。
このサイズはXがBIOSから教えてもらうのですが、
BIOSがなぜか800x600といってしまうようです。
そこで /etc/X11/XF86Configの SVGAセクションに
# Standard SVGA Device:
Section "Device"
Identifier "Generic SVGA"
VendorName "Unknown"
BoardName "Unknown"
Option "override_validate_mode" <------- この行を追加
Option "sw_cursor"
EndSection
を追加して、BIOSの言っていることを無視するようにして下さい。
これで、800x480で起動できると思います。